第十三期测序与芯片的高通量数据挖掘与分析学习班（理论+实操+课后复习视频）

导语：医药加金牌学习班已经在全国举办了几百期针对科研人员、医生、医学生普遍关注的领域，精心设计推出了多门线下学习课程，深受学员的热烈欢迎，主讲老师的专业水平也让学员们绝口称赞。

北京班 ：2019/3/23-24（22号报到） 北京金泰绿洲酒店

上海班：2019/4/3-4（2号报到）  上海中兴和泰酒店

报名方式见文末

1、

课程背景介绍

高通量数据挖掘与分析是基于生信的方法从芯片及测序高通量数据中挖掘到与研究方向最相关的靶标基因（mRNA，miRNA，lncRNA或蛋白）。随着高通量手段的不断进步，测序和芯片的成本也逐渐降低，速度也越来越快，使用高通量手段（测序/芯片）进行科研的优点非常明显，也是大势所趋！ 

做过测序或者芯片实验的科研人员越来越多，虽然测序公司已经给出了一部分的数据分析，比如过滤、质控比对、定量和差异等，但是这些分析属于基础傻瓜式的标准分析，并不能完整的讲一个故事！我们也很难在大量的差异基因中筛选获得关键基因。因此，需要我们自己掌握高通量数据挖掘的能力，从海量信息中获得自己想要的关键基因！

培训目的：

很多学员都做过测序或者芯片实验，虽然测序公司已经给出了一部分的数据分析，比如过滤、质控、比对、定量和差异等，但是这些分析属于基础傻瓜式的标准分析，并不能完整的讲一个故事！因此，需要我们自己掌握高通量数据挖掘的能力，从海量信息中获得自己想要的关键基因！

培训预期：

通过2天的培训（半天理论课程+1天半实践操作），使学员掌握生信文献分析思路和8个实用操作知识点，可以独立完成一篇基于公共数据库的高通量数据挖掘分析。

通过该主题的学习，可以学会：

高通量公共数据的详细信息查找/下载

在线做差异表达分析

在线blast分析

基因ID转换

通路map图制作

功能富集分析

蛋白互作分析

网络图的构建和美化

2、

讲师简介

宋伟博士

成果：参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请；肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建；完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。

研究方向：有近十年的生信分析经验，擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等，精通perl、R等编程语言。

培训经历：在上海、沈阳、济南、武汉等城市举办过十几场培训班。培训的对象有：医生、学生、科研工作者、生信爱好者等。

培训方向：《测序与芯片数据分析》、《生物信息学的魅力》、《生信文章实例解读》、《生信与实验的密切关系》、《生信与临床医学的关系》、《生信实用工具培训》、《多组学整合分析流程》、《R语言培训》等。

3、

课程安排

1、理论课程：第一天上午

8.30-10：00第一节：基因数据库使用介绍

测序标准报告的解读

NCBI Gene数据库：最权威的基因综合数据库之一

NCBI GEO数据库： 数据量最大的高通量公共数据库

GEO2R工具：在线做差异分析的R工具

bioDBnet：在线基因ID转换工具

Uniprot： 最权威的蛋白综合数据库之一

10.15-12：00第二节： DAVID工具——功能富集分析

功能富集的原理和意义

基因ID转换

基因功能注释（GO ，KEGG pathway）

基因功能富集（GO ，KEGG pathway）

基因功能聚类（GO ，KEGG pathway）

2、实践操作课程（共1天半）

第一天下午

13：30-17:30第三节  聚类热图及pathway map图

KEGG 数据库：最权威的通路数据库（pathway map 分析）

HEMI软件：构建聚类热图的本地软件

第二天上午

8:30-10:00第四节  STRING工具——基因/蛋白相互作用分析（PPI）

蛋白互作分析的原理和意义

单个蛋白的蛋白互作分析

多个蛋白的蛋白互作分析

STRING工具的使用步骤：输入、参数设置、输出等

10:15-12:00第五节 cytoscape网络做图软件（上）

网络图构建

逐个修改节点的属性和修改边的属性

网络展示方式layout更美观

网络统计分析

第二天下午

13:30-15:30第六节  cytoscape网络做图软件（下）

批量修改节点的属性和修改边的属性

Cytoscape的常用插件：ClusterONE

Cytoscape的常用插件：BinGO

15:30-17:00  答疑环节

4、

学习费用

两天班2800元/人，注册费包含会场、教材、专家讲课费，一小时串联视频等费用，不含住宿费，

优惠政策：

1.提前确认报名及转账的，可以提前拿到学习材料与发票

2.三人组团报名，每人优惠100元

3.四人组团报名，每人优惠200元

4.五人组团报名缴费，额外带一人免费注册！ 

5.参加过本学习班TCGA/GEO数据挖掘的学员可以享受半价优惠。

可以开正规会务发票，纸质邀请函（盖红章）。

注意事项：携带windows系统的电脑，苹果电脑请务必提前做好双系统。现场不得录音录像。

5、

住宿安排

住宿：不强行规定，可自己预订附近其他酒店，费用自理。如需预定，可与工作人员联系。

6、

培训地点

北京市东城区永外彭庄甲58号（南二环陶然桥西南侧）金泰绿洲酒店。

7、

报名咨询与报名方式

报名方式：添加微信

报名咨询可联系 金老师 18917745941  王老师  13818765978

住宿安排

北京金泰绿洲大酒店

地址：北京市东城区永外彭庄甲58号（陶然桥西南角））

普通标间/商务标间： 398元，498元/间/晚     (含早餐、含宽带)

上海中兴和泰酒店  地址：上海市浦东新区科苑路866号

普通标间/商务标间： 400元，500元/间/晚     (含早餐、含宽带)

备注：住宿统一安排，费用自理，办理住宿时告诉前台是参加此学习班的即可，住宿费办理住宿时交给酒店前台。住宿费发票将在退房时由酒店开具给您。

几年来参加过医药加金牌学习班的学员，很多学员都已经发了SCI或者拿了国自然， 我们会提供完善的售后服务，讲师也会在微信群里回答学员提出的技术问题，我们郑重承诺：一直陪伴你发SCI或者拿了国自然为止。

学习班时间： 见课程安排表   学习班地点：见课程安排表

咨询报名：请加学习班秘书微信yiyaojia01

上海课程时间地点安排表

3.9-3.10	上海中兴和泰酒店	第9期医学SCI论文撰写及发表技巧学习班
3.9-3.10	上海中兴和泰酒店
3.23-25	上海中兴和泰酒店	第12期 CRISPR/Cas9基因编辑技术（包含Base editor技术）学习班通知

3.28-29	上海中兴和泰酒店	第七期中药网络药理学的研究策略与实用技能研讨班
3.29-31	上海中兴和泰酒店	第40期全国循证医学Meta分析及网状Meta分析学习班通知
3.30-31	上海中兴和泰酒店	第三期全国临床预测模型构建与基于R语言统计分析学习班
3.30-31	上海中兴和泰酒店	全国光遗传与膜片钳技术学习班
3.30-31	上海中兴和泰酒店	2019全国科研作图高级学习班
3.30-31	上海中兴和泰酒店	第29期非编码RNA与外泌体研究策略与基金申请学习班

北京课程时间地点安排表

3.23-24	北京金泰绿洲大酒店	第12期测序与芯片高通量数据挖掘学习班
3.23-24	北京金泰绿洲大酒店	肠道菌群与代谢组学课题设计及研究策略专题学习班
3.23-24	北京金泰绿洲大酒店	第11期实用医学统计与GraphPad作图学习班

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